叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
前言卷第一摄生之一（佚）卷第二摄生之二（卷末缺）顺养六气九气调食寿限卷第三阴阳阴阳大论调阴阳阴阳杂说卷第四（佚）卷第五（卷首缺）人合阴阳合四海合十二水卷第六（卷首缺）脏腑之一五脏命分脏腑应候脏腑气液卷
吴序正文原始论疹脉辨症初热疹治合时见形论治收没论治分论麻疹始终杂症发热身冷咳嗽气喘气促呕吐吐下蛔虫烦渴谵妄发搐饮食目疾鼻症口舌牙喉病论汗腹痛泄泻痢疾大小便闭沉睡麻疳妊娠出疹盖痘疹瘾疹禁忌麻疹备用诸方
序卷一跌打损伤小引看伤有治无治之论秘传下手口诀治周身口诀损伤秘传口诀秘传接骨口诀效方开后秘传要旨总论秘传损方药名十二咏卷二总论卷三跌打水药歌观音针（一点一针）雷火针九龙针太乙救苦针又麻药方附录经验杂方
徐序鲍序卷上阳气阴气四气气相得则和不相得则病天符岁会六元正纪《灵》《素》不同《素问》传写之误《甲乙》之误王注之误心欲软肾欲坚三阳在头三阴在手脾气外绝劳风结阳结阴胃脘痈肠覃石瘕肺消四维相代四肢不举折髀水
济生方
曹序柳序缪序金序顾序自序卷上养身论运气说奇经八脉大旨六脉纲领血营气卫论君臣佐使逆从反正说吐汗下该尽治法论补泻当分缓急有无说推《内经》不宜主旺气说阳有余阴不足论病有真假辨虚损宜分阴阳施治论因病似虚因虚致
序一序二序三总论伤寒热病总论验舌色论验口唇论验二便论辨脉论南北方宜发表不同论南北方宜清里相同论三阴经热病论三阴经寒病论阴症似阳论阳症似阴论宜发表论忌发表论宜清里论忌清里论宜和解论忌和解论宜吐法论忌吐法
赠万密斋先生医书序叙叙万氏幼科源流卷之一总论大法附方卷之二背图形八症（一）？脑发？腮上背发中背发下背发腰背发暗发（骑马痈）卷之三背图形八症（二）对口正背发上搭手中搭手囊发蛇头疔蛇头疔天蛇头毒膝发卷之四
第1部分第2部分